Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trpv4Q9EPK8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpv4Q9EPK8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpv4Q9EPK8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpv4Q9EPK8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpv4Q9EPK8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv4Q9EPK8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv4Q9EPK8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv4Q9EPK8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv4Q9EPK8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpv4Q9EPK8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv4Q9EPK8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv4Q9EPK8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv4Q9EPK8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpv4Q9EPK8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms