Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan4Q9DCK3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan4Q9DCK3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms