Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Xrn2Q9DBR1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Xrn2Q9DBR1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Xrn2Q9DBR1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn2Q9DBR1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Xrn2Q9DBR1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms