Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med27Q9DB40 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Med27Q9DB40 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med27Q9DB40 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.3 ms