Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pop5Q9DB28 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Pop5Q9DB28 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Pop5Q9DB28 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Pop5Q9DB28 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Pop5Q9DB28 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pop5Q9DB28 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms