Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9DA42 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9DA42 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9DA42 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9DA42 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9DA42 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9DA42 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9DA42 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9DA42 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9DA42 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9DA42 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9DA42 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9DA42 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9DA42 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9DA42 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9DA42 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9DA42 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9DA42 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9DA42 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9DA42 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9DA42 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9DA42 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9DA42 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9DA42 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9DA42 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9DA42 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9DA42 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9DA42 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9DA42 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9DA42 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9DA42 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9DA42 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9DA42 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9DA42 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9DA42 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9DA42 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9DA42 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9DA42 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9DA42 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9DA42 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9DA42 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9DA42 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9DA42 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9DA42 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9DA42 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9DA42 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9DA42 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q9DA42 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9DA42 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9DA42 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9DA42 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9DA42 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9DA42 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9DA42 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9DA42 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9DA42 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9DA42 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9DA42 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9DA42 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9DA42 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9DA42 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9DA42 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9DA42 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9DA42 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9DA42 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9DA42 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9DA42 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9DA42 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9DA42 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9DA42 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9DA42 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9DA42 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9DA42 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9DA42 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9DA42 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9DA42 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9DA42 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9DA42 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9DA42 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9DA42 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9DA42 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9DA42 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9DA42 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9DA42 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9DA42 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9DA42 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9DA42 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9DA42 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9DA42 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9DA42 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9DA42 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9DA42 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9DA42 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9DA42 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9DA42 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9DA42 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9DA42 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9DA42 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9DA42 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9DA42 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms