Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N8

Pradc1, Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1Q9D9N8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pradc1Q9D9N8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pradc1Q9D9N8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pradc1Q9D9N8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pradc1Q9D9N8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pradc1Q9D9N8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pradc1Q9D9N8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pradc1Q9D9N8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pradc1Q9D9N8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pradc1Q9D9N8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pradc1Q9D9N8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pradc1Q9D9N8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pradc1Q9D9N8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pradc1Q9D9N8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pradc1Q9D9N8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pradc1Q9D9N8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms