Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp12Q9D9M2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp12Q9D9M2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp12Q9D9M2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms