Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Actrt1Q9D9J3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Actrt1Q9D9J3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Actrt1Q9D9J3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms