Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmco5aQ9D9D5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmco5aQ9D9D5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmco5aQ9D9D5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco5aQ9D9D5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms