Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D8N1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D8N1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D8N1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D8N1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D8N1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D8N1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D8N1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D8N1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms