Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms