Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn22Q9D7U6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn22Q9D7U6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn22Q9D7U6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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