Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Chmp5Q9D7S9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chmp5Q9D7S9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chmp5Q9D7S9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp5Q9D7S9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms