Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn23Q9D7D7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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