Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tubb4aQ9D6F9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubb4aQ9D6F9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb4aQ9D6F9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb4aQ9D6F9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms