Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn11Q9D572 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn11Q9D572 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn11Q9D572 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms