Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tomm20lQ9D4V6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tomm20lQ9D4V6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tomm20lQ9D4V6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms