Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X0

Ankrd39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39Q9D2X0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ankrd39Q9D2X0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ankrd39Q9D2X0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd39Q9D2X0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms