Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim42Q9D2H5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim42Q9D2H5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim42Q9D2H5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim42Q9D2H5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim42Q9D2H5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim42Q9D2H5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim42Q9D2H5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim42Q9D2H5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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