Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SarnpQ9D1J3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SarnpQ9D1J3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SarnpQ9D1J3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms