Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab1bQ9D1G1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab1bQ9D1G1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab1bQ9D1G1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab1bQ9D1G1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab1bQ9D1G1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab1bQ9D1G1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab1bQ9D1G1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.2 ms