Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan11Q9D1D1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tspan11Q9D1D1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan11Q9D1D1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan11Q9D1D1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan11Q9D1D1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tspan11Q9D1D1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan11Q9D1D1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan11Q9D1D1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan11Q9D1D1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tspan11Q9D1D1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan11Q9D1D1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan11Q9D1D1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms