Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ss18l2Q9D174 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ss18l2Q9D174 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ss18l2Q9D174 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms