Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cmtm6Q9CZ69 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm6Q9CZ69 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cmtm6Q9CZ69 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm6Q9CZ69 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm6Q9CZ69 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm6Q9CZ69 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm6Q9CZ69 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm6Q9CZ69 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm6Q9CZ69 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cmtm6Q9CZ69 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm6Q9CZ69 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmtm6Q9CZ69 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmtm6Q9CZ69 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms