Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snf8Q9CZ28 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snf8Q9CZ28 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms