Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prelid3bQ9CYY7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prelid3bQ9CYY7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms