Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lhfpl3Q9CTN8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl3Q9CTN8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms