Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CRC3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRC3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CRC3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CRC3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CRC3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRC3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRC3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms