Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldnd1Q9CQX5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldnd1Q9CQX5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldnd1Q9CQX5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms