Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifitm3Q9CQW9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifitm3Q9CQW9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ifitm3Q9CQW9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms