Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ5

Prr13, Proline-rich protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr13Q9CQJ5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr13Q9CQJ5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Prr13Q9CQJ5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Prr13Q9CQJ5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms