Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Npm3Q9CPP0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm3Q9CPP0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npm3Q9CPP0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npm3Q9CPP0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms