Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim12aQ99PQ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim12aQ99PQ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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