Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GpnmbQ99P91 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GpnmbQ99P91 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GpnmbQ99P91 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms