Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcc1Q99LI2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcc1Q99LI2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcc1Q99LI2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcc1Q99LI2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcc1Q99LI2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcc1Q99LI2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcc1Q99LI2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clcc1Q99LI2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcc1Q99LI2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms