Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp16Q99LG0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp16Q99LG0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp16Q99LG0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp16Q99LG0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms