Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpifQ99KR7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PpifQ99KR7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpifQ99KR7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms