Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ciao1Q99KN2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ciao1Q99KN2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ciao1Q99KN2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ciao1Q99KN2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms