Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TrabdQ99JY4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrabdQ99JY4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms