Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GatbQ99JT1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GatbQ99JT1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GatbQ99JT1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GatbQ99JT1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms