Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss28Q924N9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss28Q924N9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss28Q924N9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss28Q924N9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prss28Q924N9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prss28Q924N9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prss28Q924N9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prss28Q924N9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss28Q924N9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss28Q924N9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss28Q924N9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss28Q924N9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss28Q924N9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss28Q924N9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss28Q924N9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss28Q924N9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms