Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tom1l1Q923U0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tom1l1Q923U0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tom1l1Q923U0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms