Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csmd1Q923L3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Csmd1Q923L3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csmd1Q923L3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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