Protein–RNA interactions for Protein: Q921K8

Tcaf2, TRPM8 channel-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf2Q921K8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcaf2Q921K8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf2Q921K8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf2Q921K8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcaf2Q921K8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcaf2Q921K8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcaf2Q921K8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms