Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med28Q920D3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.7 ms