Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SncbQ91ZZ3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SncbQ91ZZ3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SncbQ91ZZ3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SncbQ91ZZ3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms