Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atl3Q91YH5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atl3Q91YH5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atl3Q91YH5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atl3Q91YH5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atl3Q91YH5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atl3Q91YH5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atl3Q91YH5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atl3Q91YH5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atl3Q91YH5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atl3Q91YH5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atl3Q91YH5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Atl3Q91YH5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atl3Q91YH5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms