Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y21

Pcdha1, Protocadherin alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha1Q91Y21 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha1Q91Y21 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdha1Q91Y21 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha1Q91Y21 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms