Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb12Q91Y07 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb12Q91Y07 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb12Q91Y07 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb12Q91Y07 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb12Q91Y07 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms